ده سال پس از بازگشت سفینه فضایی وویجر از کوادرانت دلتا، فدراسیون در بحران است. تأمین‌کنندگان اصلی کریستال‌های دیلیتیم (کاتالیزور اصلی سوخت مورد استفاده در سفرهای سریع‌تر از نور) در حال ناپدید شدن هستند. فضا و زمان در اطراف چندین سیاره تا شده و آن‌ها را از تماس خارجی ایزوله کرده است. این پدیده غیرطبیعی است - کسی یا چیزی باعث وقوع آن شده است. نیاز به متوقف کردن این وضعیت اقداماتی شدید را ضروری می‌سازد، برخی از این اقدامات خارج از صلاحیت عادی فدراسیون است.